Wpływ zmiany w CHI3L1 na poziom surowicy YKL-40, ryzyko astmy i funkcja płuc ad 7

Iloraz szans dla allelu G (CG lub GG, vs. CC) w dwóch populacjach łącznie wynosił 0,54 (95% CI, 0,41 do 0,71) (P = 1,2 × 10-5 metodą Cochrana-Mantela-Haenszela). Dyskusja
Nasze badanie pokazuje, że poziom YKL-40 w surowicy jest wysoce dziedziczną, ilościową cechą u ludzi i potwierdza, że poziom YKL-40 jest znaczącym biomarkerem na podatność na astmę i obniżoną czynność płuc. Co więcej, zmienność genetyczna w CHI3L1 wpływa na poziomy YKL-40 w surowicy i jest związana z ryzykiem astmy, nadreaktywności oskrzeli i zmniejszonej czynności płuc. Chociaż nie możemy statystycznie odróżnić między implikowanymi SNP, które są w doskonałej nierównowadze sprzężeń, prawdopodobnie jest to ~ 31C . G SNP (rs4950928) jako przyczyna SNP; znajduje się w rdzeniu promotora CHI3L1, w miejscu wiązania dla czynników transkrypcyjnych MYC i MAX. Mniejszy allel (-131G na nici do przodu) zakłóca wiązanie i opisano, że jest związany ze zmniejszoną transkrypcją w teście z lucyferazą reporterową, niższym poziomem informacyjnego RNA w komórkach krwi obwodowej i obniżonym poziomem krążącego białka YKL-40. , stwierdzono, że SNP w silnym sprzężeniu nierównowagi z -131C . G (rs946263) wpływa na poziomy transkrypcji CHI3L1 w badaniu antygenów genomewidu w komórkach od dzieci z astmą.10 Nasze wyniki są zgodne z tymi ustaleniami i wskazują, że -131G allel chroni przed astmą i osłabieniem czynności płuc, że ten efekt jest niezależny od ścieżek alergicznych (atopowych) i że wpływ tego SNP na poziomy krążenia YKL-40 występuje w chwili urodzenia.
Czy -131C . G SNP lub inny SNP w silnym sprzęcie nierównowagi z -131C . G, bezpośrednio wpływają na ryzyko astmy i obniżenia czynności płuc, czy też są to efekty fenotypowe pośredniczone przez jego wpływ na poziomy krążące YKL-40. Nasze badanie i poprzednie badania pokazujące związek pomiędzy poziomem YKL-40 w surowicy i wieloma stanami zapalnymi, 2,8, w tym astmy, 7 lub pomiędzy SNP w CHI3L1 i poziomem YKL-40 w surowicy8,9 i ekspresją genu, 9,10 sugerują, że YKL-40 jest fenotypem pośrednim dla podatności na astmę. Jednak nasze wyniki w grupie huterytów i kohorty COAST nie pozwalają nam dojść do takiego wniosku. Na przykład w Huterytach poziomy YKL-40 nie są związane z miarami czynności płuc FEV1: FVC i FEF25-75, jednak -31C . G SNP jest znaczącym predyktorem obu (Tabela 2). W kohorcie COAST, -131C . G SNP jest związany z poziomem YKL-40 w momencie urodzenia do 5 roku życia, ale nie z astmą w wieku 6 lat (Figura 3). Istnieje zatem możliwość, że zmiany w CHI3L1 wywierają wpływ na ryzyko astmy i czynności płuc niezależne od poziomu krążącego YKL-40. Formalny dowód będzie wymagał zbadania większej populacji, z określeniem zarówno poziomu YKL-40 w surowicy, jak i stanu astmy.
Podsumowując, zidentyfikowaliśmy lokus wrażliwości na astmę, CHI3L1, i wykazaliśmy, że badanie genetyki cech ilościowych (biomarkerów w surowicy) związanych z astmą może identyfikować loci podatności na astmę. W Huterytach locus CHI3L1 wyjaśnia 9,4% wariancji poziomów YKL-40 w surowicy, co sugeruje, że dodatkowe loci wpływają na poziomy YKL-40. Identyfikacja pozostałych loci, które przyczyniają się do różnic w poziomach YKL-40 w surowicy i pokrewnych białkach, może identyfikować dodatkowe geny o znaczącym wpływie na ryzyko astmy i funkcji płuc.
[podobne: Psychoterapia leczenie depresji Warszawa, leczenie niepłodności, leczenie pod mikroskopem ]