Wpływ zmiany w CHI3L1 na poziom surowicy YKL-40, ryzyko astmy i funkcja płuc cd

Związki pomiędzy SNP CHI3L1 i poziomami YKL-40 badano przy użyciu stransformowanych logicznie poziomów YKL-40 przy urodzeniu oraz w wieku 1, 3 i 5 lat w modelu regresji liniowej, z uwzględnieniem płci jako współzmiennej. Pacjenci i kontrole w astmie
Dwie populacje pochodzenia europejskiego zostały użyte do odtworzenia skojarzeń z astmą. Ludność Fryburga składa się z 344 dzieci z astmą i 294 kontrolnych dzieci bez astmy, rekrutowanych z klinik w Dziecięcym Szpitalu Uniwersyteckim we Freiburgu w Niemczech. Astma była określona przez obecność zgłaszanych objawów (kaszel, świszczący oddech lub duszność), aktualne stosowanie leków na astmę, diagnoza lekarza i nadreaktywność oskrzeli (tj. 15% spadek wartości wyjściowej wymuszonego wydechu). objętość w ciągu sekundy [FEV1] po inhalacji . 8 mg na decylitr histaminy lub . 6 minut ćwiczeń). Kontrole nie miały w przeszłości astmy, nawracających świszczących oddechów ani atopii. W sumie 64,7% pacjentów przypadało na mężczyzn, a średni wiek 10,1 lat (zakres od 6 do 16) w chwili oceny; 59,4% kontroli stanowili mężczyźni, przy średnim wieku 7,9 lat (zakres od 4 do 16) w chwili rejestracji.
Populacja w Chicago liczyła 99 pacjentów, którzy zostali rekrutowani w klinikach dla dorosłych i dzieci z Centrum Medycznego Uniwersytetu w Chicago i 197 osób z tej samej placówki medycznej. Rozpoznanie astmy w przypadku pacjentów opierało się na spełnieniu wszystkich następujących kryteriów: wiek 6 lub więcej lat, obecność co najmniej dwóch z trzech objawów (kaszel, świszczący oddech i duszność), lekarz rozpoznanie astmy ( bez sprzecznej diagnozy płucnej), nadreaktywność oskrzeli (zdefiniowana jako zmniejszenie FEV1 o . 20% po inhalacji <25 mg metacholiny na mililitr) lub wzrost o 15% lub więcej w FEV1 po leczeniu krótkodziałającym lekiem rozszerzającym oskrzela lub leczenie wziewnymi kortykosteroidami i rzadziej niż 3 tygodnie palenia papierosów. 15 Kontrolami byli dorośli rekrutowani z University of Chicago Medical Center, którzy nie mieli historii astmy (osobiście lub wśród krewnych pierwszego stopnia). Ogółem 32,5% pacjentów przypadało na mężczyzn, przy średnim wieku 24,4 lat (zakres od 7 do 74) w chwili oceny; 52,5% kontroli stanowili mężczyźni, przy średnim wieku 31,6 lat (zakres od 18 do 69) w momencie oceny.
Związki z astmą zostały przetestowane przy użyciu dokładnego testu Fishera dla różnic w genotypach i częstości alleli między pacjentami z przypadkami a grupą kontrolną. 95-procentowe przedziały ufności uzyskano z hipergeometrycznego rozkładu wpisów, w zależności od stałych marginesów. Analizę dla dwóch połączonych populacji kontrolnych przeprowadzono za pomocą metody Cochrana-Mantela-Haenszela.
Genotypowanie i kontrole jakości
Najpierw przeprowadziliśmy badanie asocjacji genomewidu w celu zidentyfikowania SNP związanych z poziomami YKL-40 w surowicy (patrz Dodatek dodatkowy). Następnie wybraliśmy SNP, aby oznaczyć wszystkie popularne haplotypy w CHI3L1 i w obrębie 15 kb powyżej swojej strony startowej transkrypcji. Zawarliśmy w analizie zwalidowany niesynonimiczny SNP rs880633, funkcjonalny promotor SNP rs4950928,9 i SNP (rs946263) uprzednio wykazano jako związane z poziomami ekspresji CHI3L1.10. Znacznik SNPs rs4950928 (-131C . G), rs880633 ( Arg145 . Gly), rs10399805, rs1538372 i rs2275352 genotypowano przy użyciu TaqMan Assay-on-Demand (ABI)
[więcej w: leczenie kanałowe pod mikroskopem, laparoskopia endometrioza, leczenie niepłodności ]